原标题：药物基因组学究竟是何方神圣？PharmGkb数据库又如何使用？

药物基因组学是近年来国内外的研究热点。发表药物基因方面的文章实验费时费力少、见刊迅速，也成为广大临床医生心中一个理想的研究方向。小至1-2分文章，大到5-10分的文章，均可见到药物基因组学研究的影子。

以药物华法林在心血管领域的研究为例（华法林是临床常见的抗凝药，广泛用于房颤、心脏瓣膜置换术后、下肢深静脉血栓的抗凝治疗中），笔者在PubMed上检索“warfarin，gene”关键词，就一共检索出1057篇相关文献，其中不乏Heart，Blood等心血管领域顶级杂志上发表的文章。

目前，以药物基因组学命名的SCI杂志有两个“Pharmacogenomics Journal”（IF=3.812）和“Pharmacogenomics”（IF=2.302），专门接受药物基因组学领域的文章。那么，药物基因组学的研究究竟是何方神圣？研究为何颇受国外杂志的青睐？

下面，笔者以华法林为例介绍药物基因组学两个重要基本概念和它具体的研究内容。

研究华法林的药物基因组学，就不得不提到两个重要的概念，药物代谢动力学（pharmacokinetics，PK）和药物效应动力学（pharmacodynamics，PD）；前者，以华法林为例，它的PK是这样的：

简单来说，就是华法林在人体肝脏内通过各种CYP酶（统称为细胞色素P450酶）代谢成各种无活性的产物并排泄出体外，这是药物华法林在体内代谢的过程；而各种CYP基因严格调控着CYP酶的活性。

它的PD则较为复杂，是这样的：

简单来说，就是华法林通过作用于VKORC1、EPHX1、GGCX、CYP4F2等酶来发挥它的抗凝效应，而VKORC1，EPHX1，GGCX，CYP4F2等基因也严格调控这些酶的活性。这样一来，药物基因组学的研究内容也就清晰了许多，即研究基因多态性（就是遗传学上所指的突变型、纯合型、杂合型）对药物代谢（基本上就是CYP一族）和药物效应（就是图3上的各种椭圆形）的影响。

提到药物基因组学，就不得不提到PharmGkb—国际遗传药理学数据库，它是由NIH（美国国家卫生研究所）赞助，目前研究药物基因组学最为全面和实用的数据库。

下面，笔者以华法林为例介绍PharmGkb数据库的具体使用（纯干货哦）：

打开具体网站：https://www.pharmgkb.org/，界面是这样的：

然后，我们检索Warfarin，它的界面弹出这样的列表：

由于篇幅限制，我们在此介绍网站上最常用的三个索引“Clinical Annotations”，“Variant Annotations”和“Literature”。

“Clinical Annotations”是临床索引，对华法林而言，它指的是哪些基因位点更能显著影响华法林的剂量差异。如下图。

绿色内容所示即临床的证据级，证据级越高（A B C D），表示这个rs位点对华法林剂量影响就越大。

“Variant Annotations”内容丰富，它列出了目前所知所有已发表的可能影响华法林剂量的rs位点，下图显示了部分rs位点。

值得注意的是，每一个rs位点后面详细列出了该位点研究的样本量、研究人群（亚洲、欧洲、非洲？）、以及差异是否具有统计学意义。

“Literature”部分非常有用，它列出了目前研究华法林药物基因组学的所有参考文献，还自带检索功能哦~

网站共收录了645种药物的药物基因组学信息。同样的，研究他汀降脂药、氯吡格雷等药物的小伙伴们，通过检索自己研究的药名，可以在网站上获得大量相关研究信息哦~

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